토양재배의 문제점은 토양이 가지고있는 성분들을 식물이 흡수하여 성장을 이루는 과정이 반복적으로 이루어지면 토양중에 존재하는 식물성장 필수성분들이 고갈되어 연작의 어려움이 있습니다.이에 반하여 수경재배는 식물성장의 필수성분들을 물에 용해시켜 주기적으로 공급하여 주기 때문에 식물의 균형성장이 촉진되고 연작의 어려움의 해소는 물론 계절의 변화에 관계없이 년중 생산이 가능한 이상적인 식물수확방식입니다.
수경재배방식은 이러한 이상적인 식물재배방식임에도 불구하고 기존의 문제점은 식물성장의 필수성분을 양액중에 용해시키는 과정에서 상호간에 화학적인 응집반응이 일어나고 응집물이 침전석출되므로서 필수성분들의 결핍현상이 발생하여 식물의 품질과 생산성을 저해할 뿐만 아니라 침전물이 배지에 누적되어 생육환경이 나빠지고 이를 해결할 수 있는 살균소독기술과 순환여과기술의 부족에 의한 양액의 주기적 배출등, 이로인한 운영비용의 증가를 초래하여 수익성 감소를 초래하는 등 많은 문제점들이 있습니다.